David Krakauer jest prezesem oraz profesorem systemów złożonych (William H. Miller Professor of Complex Systems) w Santa Fe Institute. Jego badania koncentrują się na fundamentalnej naturze materii zdolnej do rozwiązywania problemów, w odróżnieniu od zwykłej, nieożywionej materii we wszechświecie. Obejmują one zagadnienia od powstania życia po ewolucję inteligencji i głupoty na Ziemi, w tym procesy „egzosomatyzacji” (exbodiment), dzięki którym inteligencja jest wzmacniana i przenoszona na zewnątrz przy użyciu języków i artefaktów.

Badania te obejmują m.in. analizę ewolucji mechanizmów komórkowych, językowych, społecznych i kulturowych, które wspierają komunikację, pamięć oraz szeroki wachlarz systemów przetwarzania informacji. Krakauer interesuje się również historią złożoności oraz tym, w jaki sposób gry językowe, systemy reguł i paradygmaty pomagają nam rozumieć systemy wiedzy.